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| 质控菌株中文名 | 质控菌株学名 | 编号 | 质控菌株中文名 | 质控菌株学名 | 编号 |
| 大肠埃希氏菌 | Escherichia coli | ATCC25922 | 单核细胞增生李斯特氏菌 | Listeria monocytogenes | ATCC19115 |
| 福氏志贺氏菌 | Shigella flexneri | CMCC(B)51572 | 英诺克李斯特氏菌 | Listeria innocua | ATCC330090 |
| 痢疾志贺氏菌 | Shigella dysenteriae | CMCC(B)51105 | 小肠结肠炎耶尔森氏菌 | Yersinia enterocolitica | CMCC(B)52204 |
| 宋内志贺氏菌 | Shigella sonnei | CMCC(B)51592 | 弗氏柠檬酸杆菌 | Citrobacter freundii | ATCC43864 |
| 阪崎肠杆菌 | Enterobacter sakazakii | ATCC28544 | 婴儿双岐杆菌 | Bifidobacterium infantis | CICC6069 |
| 产气肠杆菌 | Enterobacter aerogenes | ATCC13048 | 德氏乳杆菌保加利亚亚种 | Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus | CICC6032 |
| 肺炎克雷伯氏菌 | Klebsiella pneumoniae | CMCC(B)46117 | 粪产碱杆菌 | Alcaligenes faecalis | CMCC(B)40001 |
| 伤寒沙门氏菌 | Salmonella typhi | CMCC(B)50071 | 植物乳杆菌 | Lactobacillus plantarum | GIM1.140 |
| 鼠伤寒沙门氏菌 | Salmonella typhimurium | ATCC14028 | 硝酸盐阴性不动杆菌 | Acinetobacter anitratum | CMCC(B)25001 |
| 肠炎沙门氏菌 | Salmonella enteritidis | CMCC(B)50335 | 创伤弧菌 | vibrio vulnificus | ATCC27562 |
| 奇异变形杆菌 | Proteus mirabilis | CMCC(B)49005 | |||
| 普通变形杆菌 | Proteus vulgaris | CMCC(B)49027 | 副溶血性弧菌 | Vibrio parahaemolyticus | ATCC17802 |
| 空肠弯曲菌 | Campylobacter jejuni | ATCC33291 | 溶藻弧菌 | Vibrio alginolyticus | ATCC33787 |
| 结肠弯曲菌 | Campylobacter coli | ATCC43478 | 铜绿假单胞菌 | Pseudomonas aeruginosa | ATCC27853 |
| 嗜水气单胞菌 | Aeromonas hydrophila | As1.172 | 枯草芽胞杆菌 | Bacillus subtilis | ATCC6633 |
| 粪肠球菌 | Enterococcus faecalis | ATCC29212 | 蕈状芽胞杆菌 | Bacillus mycoides | ATCC10206 |
| 金黄色葡萄球菌 | Staphylococcus aureus | ATCC6538 | 产气荚膜梭菌 | Clostridium perfringens | ATCC13124 |
| 表皮葡萄球菌 | Staphylococcus epidermidis | CMCC(B)26069 | 艰难梭菌 | Clostridium difficile | ATCC43593 |
| 嗜热链球菌 | Streptococcus thermophilus | IFFI6038 | 酿酒酵母 | Saccharomyces cerevisiae | ATCC9763 |
| 蜡样芽胞杆菌 | Bacillus cereus | CMCC(B)63303 | 黑曲霉 | Aspergillus niger | ATCC16404 |
| 大肠埃希氏菌O157:H7 | NCTC12900 | 金黄色葡萄球菌 | Staphylococcus aureus (B-P琼脂质控) | ATCC25923 |
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